Mida teada
- FNA-fail on FASTA-vormingus DNA ja valgujärjestuse joondamise fail.
- Avage üks rakendusega Geneious.
- Teisenda sama programmiga FASTA ja sarnastesse vormingutesse.
See artikkel selgitab, mis on FNA-fail, kuidas seda avada ja kuidas seda muusse vormingusse salvestada, näiteks FASTA, GB, VCF, pildid jne.
Mis on FNA-fail?
FNA-faililaiendiga fail on FASTA-vormingus DNA ja valgujärjestuse joondamise fail, mis salvestab DNA teabe, mida saab kasutada molekulaarbioloogia tarkvaras.
FNA-faile võib kasutada ainult nukleiinhappeteabe hoidmiseks, samas kui teised FASTA-vormingud sisaldavad muud DNA-ga seotud teavet, näiteks need, millel on FASTA, FAS, FA, FFN, FAA, FRN, MPFA, SEQ., NET või AA faililaiendid.
Need tekstipõhised FASTA-vormingud tekkisid algselt samanimelisest tarkvarapaketist, kuid nüüd kasutatakse neid DNA ja valgu järjestuste joondamise rakendustes standardina.
FNA viitab ka mõnele tehnoloogiaterminile, millel pole selle failivorminguga mingit pistmist, nagu lõplik võrgu aktsepteerimine, failinime/atribuudi suurendamise võimalus, Fujitsu võrguarhitektuur ja kiire naabri reklaam.
FNA-faili avamine
Avage üks Windowsis, macOS-is ja Linuxis rakendusega Geneious (see on 14 päeva tasuta). Selleks navigeerige menüüsse Fail > Import ja valige faili importimine Failistmenüüelement.
Võib-olla saate selle avada ka BLAST Ring Image Generatori (BRIG) abil.
Proovige Notepad++ või mõnda muud tekstiredaktorit, kui need ideed ei tööta. Fail võib tõepoolest olla tekstipõhine ja lihts alt loetav või võite avastada, et sellel pole FASTA-vorminguga mingit pistmist. Sel juhul võib faili avamine tekstidokumendina paljastada teksti, mis tuvastab, mida faili loomisel kasutati. või mis vormingus fail on.
Kuidas teisendada FNA-faili
Me ei saa seda kontrollida, kuna me pole seda proovinud, kuid teil peaks olema võimalus kasutada Geneioust faili teisendamiseks paljudesse muudesse vormingutesse, nagu FASTA, GB, GENEIOUS, MEG, ACE, CSV, NEX, PHY, SAM, TSV ja VCF. Seda saab teha programmi menüü File > Eksport kaudu.
Sama programm peaks suutma faili salvestada ka PNG-, JPG-, EPS- või PDF-vormingus, kasutades File > Salvesta pildifailina.
Kuigi tavaliselt ei saa faililaiendit lihts alt millekski muuks ümber nimetada ja eeldada, et see töötab samal viisil, saate. FNA-faili ümber nimetada. FA-failiks, kui teie konkreetne DNA sekveneerimistarkvara tuvastab ainult FA-vormingus.
Faililaiendite ümbernimetamise asemel võiksite kasutada teiste failitüüpide teisendamiseks tasuta failimuundurit. FNA- ja FA-failide puhul juhtub nii, et mõned programmid avavad ainult FA-faililaiendiga failid, mille ümbernimetamine peaks sel juhul toimima hästi.
Kas ikka ei saa seda avada?
Kui pärast ül altoodud programmide kasutamist ei saa te ikkagi oma faili avada, võite avastada, et faililaiend ei loe tegelikult. FNA-d, vaid selle asemel näeb midagi sarnast välja.
Näiteks FNG (Font Navigator Group) failid näevad kohutav alt välja nagu ". FNA", kuid kui te vaatate tähelepanelikult, on ainult kaks esimest tähte ühesugused. Kuna faililaiendid on erinevad, näitab see, et need on erineva failivorminguga ja tõenäoliselt ei tööta samade programmidega.
Sama võib öelda ka paljude teiste faililaiendite kohta, nagu FAX, FAS (Compiled Fast-Load AutoLISP), FAT, FNTA (Aleph One Font), FNC (Vue funktsioonid) ja FND (Windowsi salvestatud otsing).
Siin on mõte lihts alt veenduda, et faililaiend loeks. FNA. Kui see juhtub, proovige uuesti kasutada ül altoodud programme selle avamiseks või teisendamiseks. Kui teil on teist tüüpi fail, uurige selle laiendit, et teada saada, milliseid rakendusi on selle avamiseks või teisendamiseks vaja.
KKK
Kuidas Pythonis FNA-faili avada?
Esm alt teisendage FNA-fail FASTA-vormingusse, kasutades kolmanda osapoole rakendust, näiteks Geneious. Seejärel saate alla laadida Biopythoni, vab alt saadaolevate tööriistade komplekti bioinformaatikaga töötamiseks mõeldud bioloogiliseks arvutamiseks. Lõpuks vaadake FASTA-failidega töötamise juhiseid Biopythoni õpetusest ja kokaraamatust.
Kuidas leida oma FNA tegija numbreid esivanemate toorfailist?
Saate enamiku DNA-andmeid saidilt Ancestry.com alla laadida.txt-vormingus. Kuid ainult klientidel, kelle DNA-d analüüsiti järgmise põlvkonna sekveneerimisega (NGS), on võimalik VCF-faili alla laadida. VCF-faili allalaadimiseks peate olema DNA omanik, laskma DNA-testi teha NGS-tehnoloogia abil ja teie seadmes peab olema vähem alt 350 MB vaba ruumi.
